果树体内外都存在许多微生物，其中不少是有益的，可通过筛选应用有益微生物为果树的生长发育、提高质量、增进抗性奠定良好基础。随着人们连年耕作，过度施用化学肥料，土壤酸化板结，果树根系和体内的有益微生物越来越少，活性也逐年下降，造成果树树势弱，产量降低，果实品质下降。而菌肥可以额外提供新鲜的活菌，为果树带来新的动力。
我们先来说说微生物菌肥本身的功能！
1，对植株本身：增强植物生物防控能力，提高抗病（虫）害、抗旱、耐劳、抗寒防冻的能力。大量有益菌分泌植物促生物质，抑制病原微生物生长，提高对土传病的生物防控作用，提高抗重茬、枯萎、黄萎、根腐、根结线虫等病害的能力，使植物健壮、旺盛。
2，对土壤：改良土壤，增加土壤肥力。通过大量有益微生物活动，促使土壤形成团粒结构，增加通透性，减轻土壤板结；提高保肥、保水能力；增强水、肥、气、热、菌五个肥力因素相互协调。
3，对植物根系：生根，养根、壮根。有益菌分泌物质刺激根系迅速生长，对根系有修复和再生的功能，减少沤根，烂根，促进根系发达，使植株健壮，叶片肥厚，叶色浓绿，花色鲜艳，提高植物成活率。
4，提高肥料利用率：制造和协调农作物吸收营养。多功能微生物菌肥把土壤中植物不可溶的磷钾钙镁锌等释放游离出来供植物吸收，相当于在植物根系建立了营养库。产生的微量元素刺激根系生长，极大提高了肥料利用率。
5，调节土壤，无公害：降解硝酸盐和农药残留，修复土壤，提高农产品品质。微生物的生命活动降低硝酸盐及农药残留，调节PH值，增加氨基酸、糖分、维生素等含量。
下面再说说果树施用微生物菌肥的理由！
一、生物菌肥能改善土壤结构和营养平衡，抑制病原微生物繁殖，增加有益微生物种群数量，刺激果树根系生长，提高根系对养分的吸收，确保土壤保水保肥能力增强，可减少土壤中化学肥料的施用量。果园的土壤有机质含量低、板结、酸化、肥力流失严重的，有土传病害和重茬障碍发生等情况，可多施生物菌肥，每次施多少斤，可根据果园土壤肥力状况在农技人员指导下进行。
二、晚熟果采收后，果实出现的病害多，主要是果树养分不足，结合秋施基肥，多施生物菌肥，让树体尽快恢复健壮树势；多施生物菌肥，能修复长期施用化学肥料对土壤的破坏，给根际生长创造良好的生态环境。果树再有一月左右就快落叶了，增施生物菌肥，满足后期果树获得足够的营养储备，叶片通过光合作用，产生大量的有机养分积累，有利果树花芽分化的进行。
三、种果树有句行话说的好：树靠根长、根靠叶长、沃土养根、树势才能健壮。秋施基肥合理科学搭配，均衡各种肥的利用率，让果树吃饱喝好，给来年果树萌芽，长叶长枝，开花结果提供良好的基础。